Urodzony w 1938 roku w Korkożyszkach pod Wilnem Malanowicz skończył łódzką Filmówkę w 1963 roku.
Jeszcze przed jej ukończeniem zagrał w głośnym filmie Romana Polańskiego, z Leonem Niemczykiem i Jolantą Umecką. Film zdobył nagrodę FIPRESCI na festiwalu filmowym w Wenecji i nominację do Oskara w kategorii najlepszy film nieanglojęzyczny.
Później Zygmunt Malanowicz zagrał w takich obrazach jak "Polowanie na muchy" i "Krajobraz po bitwie" Andrzeja Wajdy, "Hubalu" Bohdana Poręby.
Grał również w serialach, m.in. w "Domu" Jana Łomnickiego.
Od roku 2000 odnosił sukcesy w warszawskim Teatrze Dramatycznym, potem w Teatrze Rozmaitości. W 2008 roku dołączył do zespołu Nowego Teatru, pod kierownictwem Krzysztofa Warlikowskiego.
