Mueller gra w Bayernie od początku kariery. Z klubem wiąże go kontrakt do 2021 roku. Media pisały w przeszłości, że 28-latkiem zainteresowany jest Manchester United.
Z Bayernem Mueller wygrał siedem razy Bundesligę, cztery razy tryumfował w Pucharze Niemiec, raz tryumfował też w Lidze Mistrzów.
Mueller prawdopodobnie znajdzie się w 23-osobowej kadrze Niemiec na mundial w Rosji.
W rozmowie z "Welt Am Sonntag" Mueller mówił wprawdzie o nowych wyzwaniach, ale jednocześnie stwierdził, że "jest trudno odejść z Bayernu" i zapewnił, że "obecnie o tym nie myśli".
Wcześniej o chęci odejściu z Bayernu władze klubu poinformował Robert Lewandowski - kapitan reprezentacji Polski wyjaśnił, że potrzebuje nowych wyzwań.