Tak w wyroku z 21 października 2015 r. orzekł Wojewódzki Sąd Administracyjny w Krakowie (I SA/Kr 1286/15).
Spółka będąca podmiotem leczniczym świadczy usługi medyczne. W jednej z oferowanych terapii zamierza wykorzystać komórki macierzyste w postaci preparatu opracowanego na potrzeby konkretnego klienta. Będzie to produkt leczniczy w rozumieniu art. 3 ust. 3 pkt 7 ustawy – Prawo farmaceutyczne. Przygotowanie preparatu powierzone zostanie podmiotowi zewnętrznemu. Za wynik terapii w całości odpowiedzialność poniesie spółka i ze względu na to jej wynagrodzenie będzie niepodzielne. Chociaż produkt jest już wykorzystywany na rynku, a jego lecznicze właściwości zostały dowiedzione, to zawiera w sobie elementy badań klinicznych w tym znaczeniu, że terapia jest zindywidualizowana i nie są pewne skutki, jakie odniesie w stosunku do konkretnego pacjenta.
We wniosku o interpretację spółka zadała pytanie, czy tak przeprowadzona terapia podlega zwolnieniu na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT. Dodatkowo spółka wniosła o potwierdzenie, że wykorzystanie w usłudze świadczeń osób trzecich nie wpłynie na klasyfikację podatkową usługi.
Zdaniem spółki terapia będzie stanowić kompleksową, niepodzielną usługę medyczną i będzie podlegać zwolnieniu z VAT. Do osiągnięcia zamierzonego celu terapeutycznego niezbędne jest prawidłowe wykonanie wszystkich elementów składowych usługi, a klient, decydując się na ofertę spółki, zainteresowany jest przede wszystkim efektem leczniczym.
Organ podatkowy zgodził się ze spółką co do niepodzielności usługi, lecz uznał jej stanowisko za nieprawidłowe w zakresie kwalifikacji podatkowej przedmiotowej usługi. Zdaniem organu oferowana usługa jest badaniem klinicznym. Chociaż pacjenci mogą odnosić z niej korzyści, to jej podstawowym celem jest sprawdzenie, czy terapia jest bezpieczna i skuteczna. Usługa w swojej istocie nie ma na celu leczenia danego schorzenia, więc nie może podlegać zwolnieniu z VAT. Nie zgadzając się ze stanowiskiem fiskusa, spółka zaskarżyła interpretację do sądu administracyjnego.