Stanisław Wyganowski urodził się w 1919 roku w Ligocie. Brał udział w kampanii wrześniowej w 1939 roku, a potem wstąpił do Armii Krajowej na Kielecczyźnie.
Po wojnie pracował jako urbanista w kraju i za granicą. W latach 70. pełnił funkcję dyrektora Instytutu Urbanistyki i Architektury. Działał też w „Solidarności".
W 1990 roku był najpierw wojewodą warszawskim, a później premier Tadeusz Mazowiecki mianował do prezydentem Warszawy. 25 czerwca 1990 roku został ponownie wybrany na to stanowisko, które zajmował do 5 października 1994 roku.
Za jego czasów kontynuowano budowę pierwszej linii metra, przygotowywano budowę spalarni śmieci czy oczyszczalni ścieków.
W 1993 bezskutecznie startował w wyborach do Senatu z ramienia BBWR.