W poniedziałek siedmioosobowy skład Naczelnego Sądu Administracyjnego wydał przełomowy wyrok dla samorządów, które chciały odzyskiwać VAT z okresu sprzed centralizacji rozliczeń. Wynika z niego, że również w okresie przejściowym tylko łączna korekta rozliczeń wszystkich jednostek w gminie otwierała drogę do odliczenia VAT od kosztownych inwestycji.
Sprawa ma charakter historyczny, ale mogła przełożyć się na wielkie kwoty zwrotów. Chodzi o rozliczenia VAT gmin po tym, jak Trybunał Sprawiedliwości UE w sprawie gminy Wrocław (C-276/14) potwierdził, że podatnikiem VAT w samorządzie jest tylko gmina. Ten wyrok, a także orzecznictwo NSA, wywróciły podejście do VAT w gminach, a ostatecznie wymusiły zmiany w przepisach i wprowadzenie centralizacji rozliczeń.
Wcześniej przez wiele lat za odrębnych podatników VAT była uznawana nie tylko gmina, ale także jej jednostki czy zakłady budżetowe.
Obowiązek centralizacji VAT w gminach wszedł w życie 1 stycznia 2017 r., dobrowolnie mogły ten proces zacząć już 1 października 2016 r.
Powstał jednak problem, czy jeszcze wcześniej, tj. przed 1 października 2016 r., jednostka samorządu terytorialnego, która w związku z wyrokiem TSUE chciała skorzystać z prawa do odliczenia, musiała dokonać centralizacji, czyli przygotować korekty rozliczeń podatku łącznie wszystkich swoich jednostek.