Naukowcy z Columbia University i New York Genome Center opracowali metodę szybkiego i dokładnego identyfikowania DNA dowolnych komórek. Technologia opisana w czasopiśmie eLife może mieć wiele zastosowań – od identyfikacji ofiar katastrofy po analizowanie miejsc zbrodni. Ale jego najbardziej bezpośrednie zastosowanie to poszukiwanie zakażonych lub patologicznych komórek nowotworowych.
Oprogramowanie jest zaprojektowane do działania na MinION – narzędziu wielkości karty kredytowej, które ściąga pasma DNA przez mikroskopijne pory i odczytuje sekwencje nukleotydów. Dzięki niewielkim rozmiarom będzie możliwe zbadanie bakterii i wirusów w terenie. Na razie jednak przez wysoki poziom błędu i duże luki w sekwencjonowaniu ograniczono jego zastosowanie do komórek ludzkich.
W innowacyjnym dwuetapowym procesie tworzenia projektu naukowcy zarysowują nowy sposób wykorzystania wartego 1000 USD MinION – stworzenia bazy danych genetycznych dostępnych online. W ten sposób będzie można szybko potwierdzić tożsamość ludzi i komórek za pomocą ich DNA z niemal doskonałą dokładnością.
Testy urządzenia pokazują, że metoda może potwierdzić tożsamość osoby po sprawdzeniu krzyżowym między 60 a 300 wariantami. Na przykład w ciągu kilku minut MinION zweryfikował tożsamość głównej autorki badania, dr Sophie Zaaijer.
Aby to zrobić, MinION porównywał odczyt genomu dr Zaaijer, pobranego z komórek policzkowych, z profilem referencyjnym przechowywanym wśród 31 000 innych genomów w publicznej bazie danych DNA.