Zakaz wypowiadania się w mediach, z wyłączeniem "Tygodnika Powszechnego", nałożył na ks. Bonieckiego w 2011 roku ksiądz Paweł Naumowicz, przełożony Polskiej Prowincji Zgromadzenia Księży Marianów.
Ks. Naumowicz napisał wówczas: "zgodnie z zasadami jasno określonymi w Kodeksie Prawa Kanonicznego i naszych mariańskich Konstytucjach, jako ordynariusz ks. Adama Bonieckiego MIC, podjąłem decyzję o ograniczeniu jego medialnej działalności do "Tygodnika Powszechnego" i tę decyzję podtrzymuję".
Ksiądz nie sprecyzował wówczas, co stało się przyczyną nałożenia zakazu na ks. Bonieckiego. Jak jednak sugerowały wówczas media, ks. Boniecki naraził się kurii m.in. uwagą, że uważa za "niefortunną" decyzję o umieszczeniu krzyża w sali plenarnej Sejmu, opowiadał się za laickością życia społecznego i bronił Adama Nergala, lidera zespołu "Behemoth".
Od 2011 roku ks. Boniecki mógł jedynie raz w tygodniu wypowiadać się na łamach "Tygodnika Powszechnego", którego jest redaktorem seniorem.
