Tak orzekł Wojewódzki Sąd Administracyjny w Bydgoszczy w wyroku 17 listopada 2014 r. (I SA/Bd 902/14).
Sprawa dotyczyła spółki komandytowej, działającej zarówno na terenie specjalnej strefy ekonomicznej (dalej SSE), jak i poza nią. Jeden z zakładów został wyodrębniony z ogólnej działalności spółki w celu zidentyfikowania dochodów korzystających ze zwolnienia na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 63a ustawy o PIT (zwolnienie z PIT dochodów podatników uzyskanych z działalności gospodarczej prowadzonej na terenie SSE). Spółka zamierzała zlecić wykonanie usługi innej spółce kapitałowej, również korzystającej z tego samego zwolnienia. We wniosku o wydanie interpretacji wspólnik zapytał, czy nabycie usługi obcej od podmiotu prowadzącego działalność na terenie tej samej SSE jest kosztem podatkowym dla ustalenia dochodu zwolnionego czy też dochodu opodatkowanego. Podatnik zajął stanowisko, że wytworzenie części produktu na terenie strefy na rzecz działalności prowadzonej poza nią nie może pozbawiać przedsiębiorcy prawa do zwolnienia podatkowego od części produkcji wytworzonej na obszarze strefy. Istotne jest, aby spełnione zostały warunki określone w zezwoleniu, dotyczące zarówno wytworzenia na terenie SSE fizycznie kompletnej konstrukcji, jak i jej części.
W ocenie organu podatkowego dochód w części, w jakiej składa się na zamówioną usługę obcą, nie korzysta ze zwolnienia, jeżeli któraś z faz działalności spółki posiadającej zezwolenie jest prowadzona przez podmiot zewnętrzny, niezależnie od tego, czy podmiot ten prowadzi działalność na terenie SSE czy nie.
Sąd nie podzielił takiej argumentacji. W ustnym uzasadnieniu powołał się na wyrok z 15 grudnia 2011 r. (II FSK 1139/10), w którym NSA uznał, że zwolnieniu podatkowemu podlegają nie tylko przychody i związane z nimi koszty będące bezpośrednio wynikiem działalności na terenie SSE, ale także przychody i koszty ich uzyskania z każdej innej działalności pomocniczej niezbędnej do jej prowadzenia. W opinii sądu, wbrew temu, co twierdzi fiskus, dla rozstrzygnięcia niniejszej sprawy ma znaczenie, czy kontrahent strony skarżącej prowadzi działalność na terenie SSE czy nie.
—Tomasz Wieczorek, współpracownik Zespołu Zarządzania Wiedzą Podatkową firmy Deloitte
