Zmiany w strukturze spółek, polegające na przejęciu jednej spółki przez drugą, wywołują wiele skutków nie tylko na gruncie prawa cywilnego. W odniesieniu do rozliczeń podatkowych należy mieć na uwadze przepisy ordynacji podatkowej, zgodnie z którymi osoba prawna łącząca się przez przejęcie innej osoby prawnej (osób prawnych) wstępuje we wszelkie przewidziane w przepisach prawa podatkowego prawa i obowiązki każdej z łączących się osób lub spółek. Spółka przejmująca nabywa więc prawa i obowiązki spółki przejmowanej, co określa się jako sukcesję podatkową. Reguła ta ma zastosowanie także w podatku od towarów i usług. Połączenie spółek ma wpływ, w szczególności, na sposób wystawiania faktur oraz odliczenie naliczonego podatku. Na kwestie związane z połączeniem powinien zwrócić uwagę nie tylko podmiot pozostający po przejęciu, ale także kontrahenci spółki przejmowanej.
Czytaj także: Połączenie spółek – skutki podatkowe
Z perspektywy kontrahenta
Przejęcie nabywcy towaru lub usługi przez inny podmiot powoduje, że sprzedawca powinien wystawić fakturę na dane spółki przejmującej. Dotyczy to także wcześniejszej sprzedaży na rzecz spółki przejmowanej. Faktura wystawiona po dniu przejęcia, ale dokumentująca sprzedaż sprzed tej daty powinna zawierać dane (nazwa nabywcy / usługobiorcy, jego adres i NIP) właściwe dla spółki przejmującej.
Rabat lub zwrot towaru
Wątpliwości mogą powstać, jeżeli po dniu przejęcia zostaje przyznany rabat lub następuje zwrot towaru, które dotyczą sprzedaży (udokumentowanej fakturą) dokonanej przed tą datą. Wymaga to ze strony sprzedawcy wystawienia faktury korygującej. Zgodnie z ogólnymi zasadami, dokument ten powinien zawierać m.in. określone dane wykazane w fakturze, której dotyczy faktura korygująca. Faktura korygująca powinna się więc odnosić do faktury pierwotnej w zakresie m.in. danych nabywcy, tzn. jego nazwy i adresu oraz NIP. Obowiązek ten należy jednak rozpatrywać zgodnie z zasadą sukcesji. Po dniu przejęcia faktura korygująca powinna więc zostać wystawiona dla spółki przejmującej, która przejmie obowiązek skorygowania rozliczeń odnoszących się do transakcji zrealizowanej na rzecz spółki przejętej. Bezcelowe byłoby bowiem podawanie danych spółki przejętej, która po dniu przejęcia traci odrębny byt prawny i staje się częścią nowego podmiotu.
Ten sposób postępowania znajduje potwierdzenie w interpretacjach organów podatkowych, np. w interpretacji Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z 9 stycznia 2018 r. (0114-KDIP1-2.4012.612.2017. 1.RM).