Organ podatkowy, ma co do zasady 60 dni na zwrot VAT. Po spełnieniu dodatkowych warunków termin ten może być krótszy. Wynosi wtedy 25 dni. Jednak, w praktyce organy podatkowe bardzo często przedłużają terminy zwrotu VAT, stwierdzając, że zasadność tego zwrotu wymaga dodatkowej weryfikacji. W efekcie, w krańcowych przypadkach przedsiębiorca może czekać na zwrot nawet kilka lat. Nie zawsze takie działanie organów jest zgodne z prawem.
Zgodnie z ustawą o VAT, jeżeli zasadność zwrotu wymaga dodatkowego zweryfikowania, naczelnik urzędu skarbowego może przedłużyć ten termin do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika dokonywanej w ramach czynności sprawdzających, kontroli podatkowej, kontroli celno-skarbowej lub postępowania podatkowego. Co do zasady organy podatkowe mogą więc prowadzić weryfikację zasadności zwrotu VAT do czasu jej faktycznego zakończenia i nie ograniczają ich tu żadne ściśle określone terminy ustawowe, co potwierdził również NSA w wyroku z 13 października 2017 r. (I FSK 167/16). Nie oznacza to jednak, że okres tej weryfikacji jest dowolny i nie podlega żadnym regułom, a w interesie przedsiębiorcy leży patrzenie urzędnikom weryfikującym na ręce.
Elementy postanowienia
Organ podatkowy może postanowieniem przedłużyć termin zwrotu VAT. Jednak tylko właściwy sposób przedłużenia będzie skuteczny. Jeśli organ zrobi to w sposób niewłaściwy, co wcale nie zdarza się rzadko, to przedsiębiorca będzie mógł odzyskać zwrot VAT wcześniej nawet jeśli nadal będzie się toczyć kontrola dotycząca jego zasadności. Oczywiście będzie to wymagało zaskarżenia wadliwego postanowienia.
Postanowienie o przedłużeniu terminu zwrotu VAT musi wskazywać konkretną datę, do której zwrot ten jest przedłużany. W przeciwnym razie będzie ono wadliwe i przedsiębiorca może domagać się wcześniejszego zwrotu.
Musi być konkretna data
Pierwszym poważnym błędem może być niewskazanie w postanowieniu o przedłużeniu zwrotu VAT, dokładnej daty do jakiej zostaje przedłużony termin. Urzędy skarbowe poprzestają wówczas jedynie na wskazaniu, że zwrot VAT zostaje przedłużony do czasu zakończenia weryfikacji zasadności jego zwrotu. Takie działanie powoduje, że przedsiębiorca właściwie nie wie kiedy zakończą się działania organu podatkowego, co narusza podstawowe standardy ochrony podatnika wynikające zarówno z krajowego, jaki i unijnego prawodawstwa i nie pozwala mu na weryfikację poczynań organu podatkowego. Zatem jedynie precyzyjne oznaczenie terminu przez urząd skarbowy, tj. poprzez wskazanie konkretnej daty, będzie prawidłowe. Potwierdził to również NSA w uchwale 7 sędziów z 24 października 2016 r. (I FPS 2/16).