Tak orzekł Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 13 grudnia 2016 r. (I FSK 255/15).
Spółka poniosła wydatki na przystosowanie wynajmowanych lub wydzierżawionych lokali lub budynków do stanu odpowiadającego potrzebom prowadzonej działalności. Wydatki na ulepszenie środka trwałego niebędącego własnością spółki są traktowane jako inwestycja w obcym środku trwałym. Po oddaniu inwestycji do użytkowania może wystąpić konieczność korekty podatku naliczonego. W związku z tym spółka zapytała organ podatkowy czy korekta odnosząca się do towarów i usług składających się na inwestycję w obcym środku trwałym może zostać zrobiona w okresie 10-letnim. Spółka podniosła, że nakłady na inwestycję w obcym środku trwałym, będącym nieruchomością, należy ujmować w grupie właściwej dla środka trwałego, który podlega ulepszeniu i amortyzować według stawek uwzględniających tę klasyfikację.
Organ podatkowy w interpretacji IPPP1/443-803/13-2/MPe nie podzielił stanowiska spółki, uznając że skoro inwestycje w obcym środku trwałym są odrębnym od nieruchomości środkiem trwałym, to korekta podatku naliczonego odnoszącego się do takiego środka powinna zostać dokonana zgodnie z art. 91 ust. 2 ustawy o VAT w ciągu pięciu lat. WSA w wyroku III SA/Wa 355/14 podzielił stanowisko podatnika. Wskazał, że sytuacja spółki ponoszącej znaczące nakłady na przystosowanie nienależącego do niej budynku do wieloletniej działalności, pozwala na analogiczne zastosowanie przy amortyzacji takiej inwestycji w obcym środku trwałym, stawek i okresu amortyzacji właściwych dla nieruchomości.
Rozpatrując skargę organu na ten wyrok, NSA uznał, że skoro zasadą jest dokonywanie korekt podatkowych w terminie 5-letnim, a termin 10-letni stanowi wyjątek przewidziany dla korekt, których przedmiotem jest nieruchomość lub prawo użytkowania wieczystego, to interpretując wyjątek ściśle, należy uznać, że niewymienienie w ustawie wprost wyjątku dla inwestycji w obcym środku trwałym, dokonanych na nieruchomościach, oznacza, że podatnik nie ma możliwości jego stosowania.
—Aleksandra Napiórkowska