Marynarz, w celu ustalenia jaką metodę powinien zastosować w swoim indywidulanym przypadku, w pierwszej kolejności powinien sprawdzić, czy z danym krajem Polska zawarła umowę o unikaniu podwójnego opodatkowania, a jeżeli taka umowa jest zawarta, to należy ustalić, jaka metoda unikania podwójnego opodatkowania wynika z zapisów tej umowy.
Obecnie popularniejszą metodą unikania podwójnego opodatkowania jest metoda wyłączenia z progresją, ale po implementacji Wielostronnej Konwencji Podatkowej (Multilateral Instrument to Modify Bilateral Tax Treaties; tzw. Konwencji MLI) przez wszystkie państwa będące jej sygnatariuszami, te proporcje ulegną zmianie.
Metoda wyłączenia z progresją
Zgodnie z zasadami tej metody, dochód z pracy, który zgodnie z postanowieniami danej umowy o unikaniu podwójnego opodatkowania może podlegać opodatkowaniu zagranicą, w Polsce jest wyłączony z opodatkowania. Ma on jednak wpływ na efektywną stawkę podatkową, jaka ma zastosowanie do innych dochodów, które w Polsce podlegają opodatkowaniu.
Stosując tą metodę unikania podwójnego opodatkowania, efektywną stawkę podatkową, jaką podatnik będzie opodatkowany za dany rok podatkowy, ustala się łącząc zarówno dochody podlegające w Polsce opodatkowaniu, jak również dochody wyłączone z opodatkowania na podstawie przepisów umowy o unikaniu podwójnego opodatkowania. Natomiast tę efektywną stawką podatkową będą opodatkowane włącznie dochody podlegające w Polsce opodatkowaniu (jeżeli podatnik takie osiąga).
Co istotne, jeżeli do dochodów osiągniętych od zagranicznego pracodawcy stosuje się metodę wyłączenia z progresją, to nie ma obowiązku wpłacania zaliczek na podatek w trakcie roku. Dodatkowo, jeżeli nie marynarz nie osiąga żadnych innych dochodów opodatkowanych w Polsce na zasadach ogólnych (18 proc., 32 proc.), np. dochodów z pracy w Polsce czy umów zleceń, to nie ma obowiązku składania w Polsce rozliczenia rocznego i deklarowania dochodów osiągniętych zagranicą.
Metoda zaliczenia proporcjonalnego
Dochody osiągnięte za pracę zagranicą, do których ma zastosowanie metoda kredytu podatkowego, podlegają w Polsce opodatkowaniu na zasadach ogólnych. Marynarz, do którego dochodów ma zastosowanie ta metoda unikania podwójnego opodatkowania, ma możliwość odliczenia od podatku obliczonego w Polsce kwoty podatku faktycznie zapłaconego za granicą. Kwota odliczonego zagranicznego podatku nie może jednak przekroczyć kwoty podatku należnego od zagranicznego dochodu w Polsce.
