Podwójne opodatkowanie może mieć wymiar prawny oraz ekonomiczny. Do podwójnego opodatkowania w sensie prawnym dochodzi w sytuacji nałożenia porównywalnych podatków przez jurysdykcje dwóch lub większej liczby państw na tego samego podatnika z tego samego tytułu i za ten sam okres. Do podwójnego opodatkowania w sensie ekonomicznym dochodzi natomiast w momencie opodatkowania tego samego dochodu lub majątku należącego do różnych podmiotów w dwóch (lub więcej) różnych krajach.
Czytaj także: Konwencja MLI nie zmieni zasad opodatkowania zakładów
Do wystąpienia podwójnego opodatkowania w sensie ekonomicznym może dojść w rezultacie przeprowadzonych kontroli podatkowych w zakresie cen transferowych. Teoretycznie, zwiększenie dochodu do opodatkowania w jednym państwie powinno wywołać odpowiednie zmniejszenie dochodu do opodatkowania w drugim państwie (poprzez korektę odpowiadającą/współzależną). Jednak w praktyce często dochodzi do sytuacji, w której organ podatkowy w jednym kraju doszacuje dochód podatnika, natomiast organy podatkowe drugiego kraju pozostawią taką sytuację bez reakcji. Dochodzi wówczas do podwójnego opodatkowania tego samego dochodu w dwóch krajach. Jeśli podatnik nie zdecyduje się na wszczęcie procedury MAP (ang. Mutual Agreement Procedure), to podwójne opodatkowanie pozostanie.
Przykład
Spółka matka mająca siedzibę w kraju A jest producentem i dystrybutorem sprzętu elektronicznego. W ramach prowadzonej działalności spółka realizuje transakcje sprzedaży towarów do spółek dystrybucyjnych z różnych krajów Unii Europejskiej. Spółki dystrybucyjne sprzedają towar do podmiotów niezależnych na swoich lokalnych rynkach. Zgodnie z polityką cen transferowych, obowiązującą w grupie podmiotów powiązanych, do kalkulacji wynagrodzenia spółek dystrybucyjnych zastosowano metodę marży transakcyjnej netto i ustalono rynkowy poziom rentowności na X proc. Wskazany poziom marży operacyjnej został ustalony na podstawie przeprowadzonej analizy porównawczej. Spółka matka po zakończeniu roku podatkowego przeprowadza korektę rentowności spółek dystrybucyjnych do poziomu X proc.