Analiza powyższych regulacji pozwala stwierdzić, że:
1. po pierwsze, nabycie przedsiębiorstwa lub jego zorganizowanej części w formie aportu, gdzie zgodnie z umową część wartości wkładu niepieniężnego zostanie przekazana na kapitał zapasowy, pozostanie bez wpływu na amortyzację podatkową nabytych w ramach aportu środków trwałych i wartości niematerialnych i prawnych,
2. po drugie, mając na uwadze, iż zasada kontynuacji dotyczy wyłącznie wartości początkowej, metody amortyzacji oraz uwzględnienia dokonanych już przez wnoszącego aport odpisów amortyzacyjnych, fakt, że składniki majątkowe tworzące przedsiębiorstwo (zorganizowaną część przedsiębiorstwa), które jest przedmiotem aportu, były amortyzowane z uwzględnieniem ograniczeń wynikających z art. 16 ust. 1 pkt 63 lit. d ustawy o CIT, nie będzie miał wpływu na prawo do dokonywania pełnych odpisów amortyzacyjnych od nabytych składników majątkowych przez nabywcę przedsiębiorstwa.
Fiskus potwierdza
Pogląd ten znajduje potwierdzenie w interpretacjach wydawanych przez organy podatkowe. Dla przykładu można wskazać stanowisko wyrażone przez Izbę Skarbową w Warszawie w interpretacji z 22 marca 2016 r. (IPPB5/4510-128/16-2/MR) oraz przez Izbę Skarbowej w Warszawie w interpretacji z 19 października 2015 r. (IPPB5/4510-823/15-2/AK).
Jako koszt uzyskania przychodów
Biorąc pod uwagę ww. regulacje oraz stanowisko organów podatkowych, warto zwrócić uwagę, że pomimo, iż aport przedsiębiorstwa (zorganizowanej części przedsiębiorstwa) nie pozwala na urealnienie wartości początkowej składników majątkowych wchodzących w jego skład dla celów podatkowych, jest możliwość potraktowania jako koszt podatkowy niedokonanych jeszcze odpisów amortyzacyjnych, których część lub całość nie mogłaby być uznana za koszty uzyskania przychodów z uwagi na to, iż dotyczą składników majątkowych nabytych w formie aportu, gdzie część lub całość wartości przedmiotu aportu zasiliła tzw. agio. Co więcej, przedmiotowy aport przedsiębiorstwa (zorganizowanej części przedsiębiorstwa) aktywujący takie odpisy amortyzacyjne nie musi w całości zasilać kapitału zakładowego nabywcy.
Problemy przy przekwalifikowaniu
Niezależnie od tego warto jednak zasygnalizować, że aport przedsiębiorstwa (zorganizowanej części przedsiębiorstwa) z tzw. agio może okazać się problematyczny w przypadku potencjalnego przekwalifikowania przedmiotu aportu przez organy podatkowe na aport poszczególnych składników majątkowych. Może się tak stać, kiedy aportowany zespół składników majątkowych nie spełnia definicji zorganizowanej części przedsiębiorstwa w rozumieniu przepisów podatkowych. Wątpliwości w tym przypadku mogą dotyczyć m.in. tego w jaki sposób stosować ograniczenia wynikające z art. 16 ust. 1 pkt 63 lit. d ustawy o CIT do składników nabytych w formie tak przekwalifikowanego aportu. Umowa aportowa przedsiębiorstwa lub jego zorganizowanej części, z reguły nie wskazuje jakie poszczególne składniki majątkowe wnoszonego przedsiębiorstwa (zorganizowanej części przedsiębiorstwa) zasilają kapitał zakładowy, a jakie zostają przekazane na tzw. agio.
