W listopadzie 2019 r. centrum psychiatrii wystąpiło o interpretację podatkową dotyczącą PIT. Wyjaśniło, że jest płatnikiem tego podatku w stosunku do zatrudnianych pracowników. Pracownicy centrum od maja 2003 r. do września 2006 r. otrzymywali świadczenia z zakładowego funduszu świadczeń socjalnych w równej wysokości, tj. bez zachowania kryterium socjalnego.
Po kontroli Zakładu Ubezpieczeń Społecznych w kwietniu 2012 r. zakwestionowano wypłatę tych świadczeń i naliczono od przekazanych kwot składki ubezpieczenia społecznego. Centrum nie zgadzało się z tym, ale w 2015 r. sąd ostatecznie oddalił jego apelację w sprawie ustalenia składki na ubezpieczenie społeczne i zdrowotne na blisko 300 tys. zł. W tej sytuacji centrum zawarło z zus ugodę obejmującą warunki spłaty tego zobowiązania w sześćdziesięciu ratach do stycznia 2022 r.