Podatniczka jest akcjonariuszem spółki z ograniczoną odpowiedzialnością spółki komandytowo-akcyjnej. Jej akcjonariusze rozważają różne scenariusze dalszych losów działalności, m.in. likwidację podmiotu. Firma wskazała, że w przypadku likwidacji doszłoby do podziału majątku pomiędzy jej wspólników. Jako akcjonariusz wnioskodawczyni otrzymałaby zarówno środki pieniężne, jak i inne składniki majątku (np. wierzytelności wobec kontrahentów).
Spółka zapytała, czy w przypadku likwidacji i podziału majątku likwidowanego podmiotu pomiędzy wspólników byłaby ona zobowiązana do zapłaty CIT od wartości otrzymanych składników.
Fiskus odpowiedział, że zgodnie z linią orzeczniczą, która uformowała się po wydaniu przez Naczelny Sąd Administracyjny uchwały z 16 stycznia 2012 r. (II FPS 1/11), akcjonariusz spółki komandytowo-akcyjnej jest opodatkowany na poziomie wypłaconej mu dywidendy, która jest jego przychodem w momencie podjęcia uchwały lub w ustalonym dniu dywidendy. W ten sam sposób jest opodatkowana ewentualna zaliczka na poczet dywidendy wypłacana akcjonariuszowi spółki komandytowo-akcyjnej.
To stanowisko zaakceptował sąd pierwszej instancji. Po analizie przepisów, w tym konstytucji, doszedł do przekonania, że w przypadku zatrzymania zysku w spółce komandytowo-akcyjnej i jego dystrybucji na rzecz akcjonariusza dopiero w momencie likwidacji tej spółki środki takie będą podlegały opodatkowaniu na podstawie art. 12 ust. 1 ustawy o CIT. Przeciwne stanowisko, w ocenie sądu, mogłoby prowadzić do faktycznego wyłączenia z opodatkowania podatkiem dochodowym przychodów określonej kategorii osób prawnych. Wystarczyłoby skumulowanie na dzień likwidacji spółki komandytowo-akcyjnej przychodów osiągniętych z udziału w tej spółce. A takie wyłączenie narusza konstytucyjną zasadę powszechności i równości opodatkowania.
Spółka zaskarżyła ten wyrok, ale Naczelny Sąd Administracyjny nie przyznał jej racji. NSA zgodził się, że w przedstawionym we wniosku stanie faktycznym podstawą prawną opodatkowania jest art. 12 ust. 1 pkt 1 ustawy o CIT, którego konstytucyjności nikt dotychczas nie kwestionował. Zdaniem NSA akcjonariusz spółki komandytowo-akcyjnej powinien rozpoznać przychód na podstawie tego przepisu na dzień likwidacji spółki komandytowo-akcyjnej, jeszcze przed jej definitywną likwidacją, ale po spłaceniu wymagalnych zobowiązań wobec innych wierzycieli. Przychód ten powinien zostać ustalony przez zsumowanie kwot otrzymanych środków pieniężnych oraz wartości otrzymanych składników majątkowych innych niż pieniądze.