O wydanie interpretacji wystąpiła spółka z branży lotniczej, której działalność częściowo została zlokalizowana w specjalnej strefie ekonomicznej (SSE). W 2012 r. spółka włączona została do ogólnoświatowej grupy kapitałowej. W prowadzonej działalności gospodarczej intensywnie współpracuje z innymi spółkami z grupy (w tym z prowadzącymi działalność na terenie SSE). W celu rozwoju zdolności operacyjnych, redukcji kosztów ogólnych oraz centralizacji procesów, rozważa utworzenie z podobnymi do siebie spółkami podatkowej grupy kapitałowej (PGK). Spółka zaznaczyła, że spełnione są wszelkie warunki do utworzenie grupy. Postanowiła się jedynie upewnić, że strefowe zwolnienie od CIT nie jest zwolnieniem przyznawanym na podstawie odrębnych ustaw, co wykluczałoby uczestnictwo w grupie.
Ku zaskoczeniu firmy fiskus uznał, że w przypadku prowadzenia działalności na terenie strefy oraz korzystania ze zwolnienia strefowego spółka nie może być uczestnikiem PGK.
Spółka poszła do sądu i wygrała. Najpierw rację przyznał jej Wojewódzki Sąd Administracyjny w Rzeszowie. Sąd nie miał wątpliwości, że podatnik, który korzysta z preferencji dla działalności w SSE, może być uczestnikiem PGK. Skoro podstawą zwolnienia dochodu osiąganego w SSE jest art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, to korzystanie z niego przez jedną ze spółek tworzących PGK, która planuje uzyskać zezwolenie w strefie, nie powoduje utraty statusu grupy jako podatnika CIT. W ocenie WSA ustawodawca, wprowadzając ograniczenie dla działania w PGK w postaci niepodlegania zwolnieniu na podstawie odrębnych ustaw, równocześnie wprowadził do ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych zwolnienie od tego podatku dla dochodów uzyskanych z działalności gospodarczej prowadzonej na terenie SSE.
To samo powtórzył Naczelny Sąd Administracyjny. Po analizie przepisów zauważył, że ustawa o CIT to ta, w której powinna znaleźć się regulacja dotycząca zwolnień z tego podatku. Ustawa o specjalnych strefach ekonomicznych ma bowiem regulować zasady i tryb ustanawiania specjalnych stref ekonomicznych na terenie Polski, zarządzania nimi oraz szczególne zasady i warunki prowadzenia tam działalności. Analiza zmian legislacyjnych wskazuje ponadto, że ustawodawca dążył do regulacji zwolnień podatkowych, związanych z działalnością strefową, właśnie w ustawach o podatkach dochodowych. W ustawie o specjalnych strefach ekonomicznych wskazano jedynie na możliwość skorzystania ze zwolnienia podatkowego.
Wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego z 22 lutego 2018 r.