Otrzymanie przez przedsiębiorcę zawiadomienia informującego o zamiarze przeprowadzenia kontroli podatkowej powinno wyzwolić szereg usystematyzowanych działań w firmie, gdyż właściwe zaangażowanie ma wpływ na cały jej przebieg. Zachowanie czujności, eliminowanie błędów popełnianych podczas wstępnej fazy kontroli podatkowej poprzez świadome działanie przedsiębiorcy to kluczowa reakcja jaka powinna towarzyszyć w jej trakcie.
Istota merytoryczna kontroli skarbowej sprowadza się przede wszystkim do zweryfikowania rzetelności zadeklarowanej podstawy opodatkowania oraz prawidłowości obliczania i regulowania podatków, ujawnienie nie zgłoszonej do opodatkowania działalności gospodarczej w tym wykrycie zatajonych dochodów (nieujawnione źródła).