Ministerstwo Finansów szacuje, że procedura akceptacyjna zakończy się nie wcześniej niż w trakcie roku 2019.
Jeśli Komisja Europejska wyrazi zgodę na wprowadzenie tego rozwiązania, to w praktyce w niektórych branżach takich jak budowlana, handel elektroniką, stalą i paliwami nabywca towarów lub odpowiednio usług będzie zobligowany do rozliczenia faktur za pomocą mechanizmu podzielonej płatności. Zgodnie z komunikatem MF obligatoryjna podzielona płatność ma być wprowadzana fazami. Po fazie dobrowolnego charakteru nastąpiłby etap obligatoryjności rozliczeń dla wybranych branż, a ostatecznie rozszerzenie tej formuły rozliczenia na wszystkie branże musiałoby być uzgodnione z organami EU.
Wydaje się, że formalnie dobrowolny mechanizm podzielonej płatności w praktyce zmusi jednak większość przedsiębiorców do jego stosowania, nawet bez wyraźnej woli z ich strony. Biorąc pod uwagę ograniczenia w możliwości dysponowania środkami otrzymanymi na rachunek VAT, w praktyce przedsiębiorcy będą zmuszeni bądź sami wykorzystywać zgormadzone tam środki na potrzeby rozliczenia VAT w procedurze podzielonej płatności, bądź wnioskować o przekazanie środków na rachunek rozliczeniowy. W tym ostatnim przypadku, jak można wnioskować z powszechnej praktyki występowania o zwrot nadwyżki naliczonego VAT, należy liczyć się z wszczęciem czynności sprawdzających lub kontroli podatkowej.
Rachunki powiernicze
Niewykluczone są również dalsze prace nad rozszerzeniem przedmiotowym stosowania podzielonej płatności. Zgodnie z nowymi regulacjami rachunki VAT będą automatycznie tworzone przez banki do rachunków rozliczeniowych podatników VAT. Rachunki VAT nie mogą być jednak tworzone dla innych rachunków bankowych niż rachunki rozliczeniowe, przykładowo dla rachunków powierniczych.
W efekcie, realizacja płatności za zobowiązania handlowe na rachunki powiernicze wierzycieli nie będzie mogła być realizowana za pomocą podzielonej płatności. Rachunki powiernicze występują szczególnie często w przypadku realizacji kontraktów budowlanych, gdy wykonawcą jest nie pojedyncza firma, ale ich konsorcjum. Brak możliwości rozliczenia zapłaty na taki rachunek za pomocą podzielonej płatności może wiązać się z istotnymi dolegliwościami dla zamawiających, szczególnie w kontekście ochrony wynikającej z zachowania dobrej wiary w weryfikacji kontrahentów i wynikających z takiej sytuacji ryzyk potencjalnej odpowiedzialności za zobowiązania podatkowe kontrahenta.
Rachunki escrow
W obrocie gospodarczym szeroko stosowane są również tzw. rachunki escrow, na które trafiają kwoty należności z różnego typu transakcji, które mogą zostać zwolnione wyłącznie w przypadkach ściśle określonych umową stron (np. transze płatności za wykonane usługi czy zakupione towary, udziały lub akcje). Środki takie nie mogą być przeznaczane na uregulowanie innych zobowiązań pod rygorem naruszenia umowy escrow.