Działalność podjął 1 października 1990 r. Obejmował wówczas swoją właściwością obszary ówczesnych sądów okręgowych w Białymstoku, Łomży i Suwałkach. 1 lipca 2001 r. objął Sąd Okręgowy w Olsztynie. Od 1 sierpnia 2010 r. znalazł się w nim Sąd Okręgowy w Ostrołęce. Uroczyście obchodzono zarówno 20-lecie, jak i 25-lecie Sądu Apelacyjnego w Białymstoku. W związku z 20-leciem wydano księgę pamiątkową.
Według stanu na 31 października 2017 r. w całej apelacji białostockiej było 615 etatów sędziowskich, w tym 17 nieobsadzonych; etatów asesorskich 15, w tym 7 wakatów; etatów asystenckich 182 – wszystkie obsadzone; etatów referendarskich 120, w tym 8 nieobsadzonych; etatów kuratorskich 362, w tym 8 nieobsadzonych; etatów urzędniczych 1692, w tym 57 nieobsadzonych.
W 2016 r. do wszystkich sądów apelacji białostockiej wpłynęło 768 625 spraw (nie licząc wieczystoksięgowych i rejestrowych). Zostało zaś załatwionych 773 818 spraw. W pierwszym półroczu 2017 r. wpływ wyniósł 395 533 spraw. Średni czas rozpoznania w pierwszej instancji w apelacji białostockiej w 2016 r. wynosił 4,3 miesiąca (nie wliczając wieczystoksięgowych i rejestrowych), a w pierwszym półroczu 2017 r. 4,4 miesiąca. Najszybciej rozpoznawane są sprawy w Sądzie Rejonowym w Sokółce: w 2016 r. 2,3 miesiąca, a w pierwszym półroczu 2017 r. 2,2 miesiąca.
To interesuje wszystkich
W 2016 r. w SO w Suwałkach zorganizowana została pokazowa lekcja sprawiedliwości. Młodzież oraz licznie przybyła publiczność z zainteresowaniem przyglądała się rozprawie. Po przeprowadzeniu całego postępowania sądowego wydane zostało orzeczenie. Publiczność na koniec zadawała pytania sędziemu, prokuratorowi i adwokatowi. Opinie osób uczestniczących w lekcji były bardzo pozytywne i wskazywały na zasadność przeprowadzania podobnych w przyszłości.
SO w Olsztynie uczcił też przypadający na 14 czerwca Dzień Ławnika Polskiego. Kierownictwo sądu podczas kameralnego spotkania wręczyło wyróżnionym ławnikom dyplomy za zaangażowanie, wysoką kulturę osobistą i godne reprezentowanie zawodu ławnika sądowego.