W czerwcu 2012 r. spółka złożyła korektę deklaracji na podatek od nieruchomości za 2008 r. Przyczyną złożenia korekty była zmiana sposobu opodatkowania budynku i budowli dawnego hotelu w związku z utratą od 2004 r. możliwości prowadzenia działalności na powierzchni ponad 10 tys. mkw. tego budynku.
Po przeprowadzeniu postępowania podatkowego prezydent miasta potwierdził, że ogólny stan techniczny budynku jest zły. Jednak w jego ocenie zgodnie z dokumentacją nie jest to proces nieodwracalny. Zdaniem organu podatkowego kluczowym dokumentem jest protokół z okresowej (rocznej) kontroli stanu technicznego budynku. Wynika z niego, że ponieważ budynek wraz z całą infrastrukturą jest nieeksploatowany od listopada 2002 roku, ulega stopniowej i stałej degradacji. Należy jak najszybciej przystąpić do kompleksowej rewitalizacji i modernizacji całego obiektu, wraz z otoczeniem, które nadal nadaje się do pełnienia funkcji hotelowej, gastronomicznej i usługowo-handlowej – zgodnie z założeniami projektowymi. Zdaniem prezydenta budynek, po przeprowadzeniu modernizacji, będzie mógł pełnić swoją dawną funkcję, a jego obecny zły stan techniczny nie stanowi względów technicznych w rozumieniu art. 1a ust. 1 pkt 3 ustawy o podatkach i opłatach lokalnych. W jego ocenie względy techniczne nie mogą być bowiem utożsamiane z przeszkodami o charakterze przejściowym.
Samorządowe Kolegium Odwoławcze stwierdziło, że niewykorzystywanie danych przedmiotów opodatkowania w prowadzonej działalności gospodarczej na skutek braku takiej możliwości z innych względów niż techniczne nie wyłącza spod opodatkowania budynków, budowli czy gruntów jako związanych z działalnością gospodarczą. Pojęcie „względy techniczne" nie obejmuje swoim zakresem przyczyn technologicznych, ekonomicznych bądź finansowych.
Spółka zaskarżyła decyzję, ale przegrała. Najpierw WSA w Krakowie uznał, że sporny budynek byłego hotelu zasadnie objęto opodatkowaniem jako związany z prowadzeniem działalności gospodarczej. Ostatecznie stanowisko niekorzystne dla podatniczki potwierdził też Naczelny Sąd Administracyjny.
NSA przypomniał, że podstawowym kryterium związku z działalnością gospodarczą jest samo posiadanie danej nieruchomości przez podmiot prowadzący tę działalność. Związek danej nieruchomości z prowadzeniem działalności oznacza także związek pośredni i nie może być utożsamiany jedynie z działalnością faktyczną. O tym, czy dana nieruchomość pozostaje związana z działalnością gospodarczą, nie przesądza to, czy jest ona w danym obiekcie rzeczywiście prowadzona, ale to, czy nieruchomość jest w posiadaniu przedsiębiorcy.
